La SEMPAT étant une société d’économie mixte, son capital est détenu à 58,03% par des actionnaires publics et à 41,97% par des actionnaires privés.
Le 30 août 2005, la SEMPAT a procédé à une augmentation de capital et a permis à trois nouveaux actionnaires d’entrer dans ce capital : Alstom, Batifranc, Dexia.

Les actionnaires publics :

• Conseil général du Territoire de Belfort
  
• Syndicat de l’Aéroparc Belfort-Fontaine
  
• Communauté de l'Agglomération Belfortaine
  
• Ville de Belfort

Les actionnaires privés :

• Caisse des Dépôts et Consignations
• Caisse d'épargne de Franche-Comté
  
• Alstom
  
• Société d'Equipement du Territoire de Belfort (SODEB)
  
• Batifranc
  
• Dexia
  
• Chambre de Commerce et d'Industrie du Territoire de Belfort